Gebaseerd op de gelijknamige MTV animatie serie van Peter Chung, wordt de film Aeon Flux 2 december 2005 gereleased.

De film speelt zich 400 jaar in de toekomst af, wanneer ziektes 99% van de wereldbevolking heeft uitgeroeid. Een ommuurde stadstaat, Bregna, wordt door de overlevenden bewoond en wordt geregeerd door een groep wetenschappers.

Het verhaal centreerd zich op Aeon Flux (gespeeld door Charlize Theron), een van de beste strijders van de ondergrondse beweging 'Monican', geleid door The Handler (gespeeld door Frances McDormand). Als Aeon er op uitgestuurd wordt om de regeringsleider om te brengen, ontdekt ze een wereld van geheimen.